O Museu Quinta das Cruzes possui como principal vocação estudar, documentar, conservar, valorizar e divulgar as colecções que detém, bem como apoiar e colaborar na salvaguarda, estudo e divulgação do património. Em articulação com estes objectivos, o Museu disponibiliza os seus serviços que se dividem nas áreas de Biblioteca, Conservação e Restauro, Gestão de Colecções e Inventário e Serviço Educativo a todos os públicos.
O Museu dispõe ainda de uma loja e serviços de cafetaria/restaurante.